导致子宫内膜偏薄，可能由多种原因引起，主要有内分泌因素，发育的异常，损伤等等。最常见的是内膜炎症和医源性的原因。此外血管分布不好和雌激素水平低，也可能导致子宫内膜生长不良。急性或者是慢性的感染，导致子宫内膜基底层的破坏，反复或者强烈的刮宫手术，以及宫腔镜下的子宫粘膜下肌瘤切除术，也会引起子宫内膜基底层的破坏和内膜的黏连，从而影响子宫内膜生长。子宫内膜薄会造成流产率增加，诱发妇科疾病和导致不孕不育。有研究表明，子宫内膜厚度大于七毫米时，妊娠率有51%左右。当子宫内膜厚度小于七毫米时，妊娠率只有26%，流产率也随之上升。